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MCU指微控制器，MPU指微處理器。

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MCU集合了FLASH、RAM還有一些外圍設備。MPU的FLASH和RAM當然，設計師需要自己建造。MCU也可外擴。MPU電路設計相對MCU較為復雜。

MCU一Fairchild代理般使用片內FLASH存儲和執行程序代碼，MPU在外面存儲代碼FLASH中間，上電后將代碼搬運到RAM中運行。因此MCU啟動速度更快。MCU雖然代碼也可以運行RAM但內部RAM容量小，使用外部擴展RAM速度比內部慢。MPU主頻相對較高，外部內存通常是DDR3,DDR這種速度比較快，適用于復雜的操作。

MCU沒有內存管理單元（MMU），不能運行Linux該操作系統只能運行小型操作系統，因此不能運行多過程。小型操作系統RTOS多任務類似于多線程。

MCU相對MPU實時性更強。

MCU相對MPU功耗較低。MPU也有低功耗模式，但不像MCU那么低。

至于如何選擇，就是使用MCU還是MPU綜合考慮性能要求、體積重量要求、預算成本等方面。一般地，MCU傾向于低成本低功耗，MPU傾向于高性能。目前的MCU和MPU邊界逐漸模糊，MCU主頻也在增加，外設也在增加。在遠程控制、消費電子或實時要求高的場合使用MCU更多的在計算量大、互聯速度高或圖形交互要求高的地方使用MPU多一些。也可按要求使用MCU和MPU現在很多芯片同時都有MCU和MPU多核，更方便設計師使用。